Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms