Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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