Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nucb2P81117 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nucb2P81117 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nucb2P81117 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nucb2P81117 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nucb2P81117 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nucb2P81117 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nucb2P81117 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nucb2P81117 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nucb2P81117 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms