Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms