Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nedd4P46935 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd4P46935 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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