Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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