Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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