Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prim1P20664 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms