Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms