Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms