Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Ccl2P10148 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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