Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms