Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp35M0QWN7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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