Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20828J3KMI7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm20828J3KMI7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20828J3KMI7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20828J3KMI7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20828J3KMI7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20828J3KMI7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20828J3KMI7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm20828J3KMI7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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