Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp32F8VPZ3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms