Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Susd1E9Q3H4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms