Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Myo5cE9Q1F5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms