Protein–RNA interactions for Protein: D3YX03

Gm7849, Predicted gene 7849, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7849D3YX03 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm7849D3YX03 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm7849D3YX03 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm7849D3YX03 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm7849D3YX03 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm7849D3YX03 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm7849D3YX03 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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