Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upf2A2AT37 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms