Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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