Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn13Q9Z0S4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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