Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec4eQ9R0Q8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec4eQ9R0Q8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec4eQ9R0Q8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec4eQ9R0Q8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec4eQ9R0Q8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec4eQ9R0Q8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clec4eQ9R0Q8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clec4eQ9R0Q8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4eQ9R0Q8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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