Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChmQ9QXG2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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