Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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SrfQ9JM73 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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SrfQ9JM73 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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