Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Slc28a3Q9ERH8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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