Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc97Q9DBT3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc97Q9DBT3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms