Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms