Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms