Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms