Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms