Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2cQ9D1C1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms