Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Mms19Q9D071 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mms19Q9D071 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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