Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ndufb9Q9CQJ8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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