Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms