Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms