Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlgn1Q99K10 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlgn1Q99K10 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms