Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms