Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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