Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lrit1Q8K099 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lrit1Q8K099 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lrit1Q8K099 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrit1Q8K099 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrit1Q8K099 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrit1Q8K099 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrit1Q8K099 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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