Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Yod1Q8CB27 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Yod1Q8CB27 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Yod1Q8CB27 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Yod1Q8CB27 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Yod1Q8CB27 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Yod1Q8CB27 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms