Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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