Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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