Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf144bQ8BKD6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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