Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms