Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc29Q80VM3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms