Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms