Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms