Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Topbp1Q6ZQF0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms