Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bend3Q6PAL0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bend3Q6PAL0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bend3Q6PAL0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bend3Q6PAL0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bend3Q6PAL0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms