Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC061212Q6P8K3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms